日時　2011/12/14 (水)（第2日目）17:50 – 19:30
会場　第9会場（会議センター 4階 411+412）

セッション名
2T9pII 分子構造・生命情報
オミクス/ポストゲノム解析・バイオインフォマティクス

プログラム

1. 2T9pII-1(2P-0166) Quantitative Proteomic Analysis of Caenorhabditis elegans pgl-1 Mutants Grown at 20°C and 25°C
   ○遠里 由佳子1，物部 香奈美1，早野 俊哉2，川崎 一郎3，伊藤 將弘1
   1立命館大・生命科学・生命情報，2立命館大・生命科学・生命医科，3Dept. of Biosci. & Biotech., Univ. of Konkuk, Korea.
2. 2T9pII-2(2P-0165) 線虫Caenorhabditis elegansの発生ステージ比較プロテオーム解析
   Quantitative Proteomic Analysis of 3 Developmental Stages in Caenorhabditis elegans
   ○物部 香奈美1，石堂 佑典1，遠里 由佳子1，早野 俊哉2，伊藤 將弘1
   1立命館大・生命科学・生命情報，2立命館大・生命科学・生命医科
3. 2T9pII-3(2P-0157) 定量的リン酸化プロテオミクスとバイオインフォマティクスを用いた大腸がんリン酸化シグナル伝達機構の包括的理解
   Comprehensive understanding of phosphorylation signaling in colorectal cancer using phosphoproteomics and bioinformatics
   ○久家 貴寿1，足立 淳1，白水 崇1，村上 達夫1，松原 久裕2，松本 雅記3，中山 敬一4，福岡 順也5，朝長 毅1
   1医薬基盤研・プロテオームリサーチ，2千葉大・院・医・先端応用外科，3九州大・生体防御医学・プロテオミクス，4九州大・生体防御医学・分子医科学，5富山大附属病院・外科病理学
4. 2T9pII-4(2P-0163) チロシンキナーゼ同定に向けた植物タンパク質キナーゼプロファイリング
   Profiling of Protein Kinase in Plant toward Identification of Tyrosine Kinase
   ○海老 敬行1，根本 圭一郎2，杉山 直幸1，冨田 勝1，澤崎 達也2，石濱 泰1,3
   1慶大先端生命研，2愛媛大無細胞工学研センター，3京大大学院薬学研
5. 2T9pII-5(2P-0147) ラボオートメーションを活用した全自動実験室進化システムの構築
   Development of automatic experimental evolution system using laboratory automation system
   ○源 晃明1，堀之内 貴明2，古澤 力1,2，清水 浩1
   1阪大院情報・バイオ情報，2理研・QBiC
6. 2T9pII-6(2P-0171) 13C同位体標識メタボロミクスデータを用いた酵素キネティクス最適化手法の開発
   Metabolomics approach for optimization of enzyme kinetics based on 13C-labeling
   ○佐伯 憲和1,3，戸谷 吉博1，西野 泰子1,2，冨田 勝1,3
   1慶大・先端生命研，2慶大・政策メディア・先端生命，3慶大・環境情報
7. 2T9pII-7(2P-0131) RefEx: Reference Expression Dataset for functional analysis of transcriptomes
   ○小野 浩雅，内藤 雄樹，米澤 明憲，坊農 秀雅
   情・シ機構　ライフサイエンス統合DBセ
8. 2T9pII-8(2P-0197) HemopexinはTTRのアミロイド線維化のkey moleculeである
   Hemopexin may be a key molecule for fibrillogenesis in the TTR Amyloid
   ○高岡 裕1,2，波多野 直哉3，佐藤 泰生4，三浦 研爾1，小田 剛1，菅野 亜紀1，大田 美香1,2，前田 英一1
   1神戸大・医・医療情報，2神戸常盤大・ライフサイエンス研，3神戸大院・医・質量分析セ，4岩手医大・歯・口腔病理
9. 2T9pII-9(2P-0248) アルツハイマー病の遺伝子発現データに基づくネットワーク解析
   Network analysis of gene expressions along with the progression of Alzheimer’s disease
   ○菊地 正隆，荻島 創一，田中 博
   東京医歯大・生命情報学
10. 2T9pII-10(2P-0249) Network-based inference of signature genes of Alzheimer disease as an attractor of disease state
    ○荻島 創一1，菊地 正隆1，宮下 哲典2，桑野 良三2，田中 博1
    1東京医歯大・難研・生命情報学，2新潟大学・脳研

日本では文科省リーディングプロジェクト「オーダーメイド医療実現化プロジェクト」が推進されており、第1期（平成15年度-19年度）では約30万症例のDNA・血清試料を集めたバイオバンク・ジャパンが構築され、第2期（平成20年度-24年度）ではこの試料を活用して、遺伝情報解析が進められ、36の疾患関連遺伝子、12の薬剤関連遺伝子が同定されてきた。今年6月には医療イノベーション会議が「医療イノベーション推進の基本的方針」において、医療分野が今後のわが国の経済成長を担う重点分野として個別化医療を推進することが掲げられており、バイオバンク・ジャパン、個別化医療への期待が高まっている。

本シンポジウムは文科省リーディングプロジェクト「オーダーメイド医療実現化プロジェクト」の主催で開催された。アメリカでは、患者団体が試料やグラントを研究者に提供するなどして協力して疾患研究を進め、患者団体がバイオバンクを運営する取り組みも始まっているとのことで、本シンポジウムではハンチントン病の研究を推進してきた遺伝病財団(Hereditary Disease Foundation) 理事のアリス・ウェスクラーさん、弾力性繊維性仮性黄色腫(PXE)の研究を推進してきたジェネティック・アライアンス代表のシャロン・テリーさんがこれまでの取り組みを講演された。

ハンチントン病の母をもつ歴史学者。カリフォルニア大学ロサンジェルス校女性学研究センター研究員。母親の診断後、父や妹とともに、ハンチントン病の原因を見つけるため、研究者探しに奔走し、研究用の寄付金を集めてきた。1979年から20年間にわたり、ベネズエラにあったハンチントン病の大家系を一軒ずつまわり、4000名から血液提供を受けていったことが知られている。これらの血液は、ハンチントン病の遺伝子の発見に大きく貢献し、医学研究に深くかかわるアメリカの患者・家族のモデルとなった。1986年、一家はハンチントン病の研究を推進するため、遺伝病財団(Hereditary Diseases Foundation)を創設し、現在も研究者をサポートしている。代表作に、ハンチントン病のリスクをもった娘としての葛藤を描いた“ウェクスラー家の選択” 新潮社(2003)がある。

BioHackathon 2011のテーマは”Linked Dataを扱うための技術開発”である。バイオサイエンスデータベースセンター (NBDC) とライフサイエンス統合データベースセンター (DBCLS) では、ライフサイエンス分野のデータベースの統合の基盤としてRDF の利用を推進している。医学生物学の異種多様なデータを統合するには RDF をLinked Data (RDF)の利用が有効と考えられるためである。BioHackathon 2011では、そのための技術開発を行う。オントロジーの整備からWebサービスやデータベース記述の標準化が必要になるが、国内外から主要な開発者が参加し、face-to-faceで顔をあわせて開発会議を行おうというものである。

シンポジウムのプログラムは以下の通りである:

やはりこうして開発者がface-to-faceで顔をあわせて、議論したり、ハッキングすることでイマージしてくるものがある。こうした貴重な機会を提供しているオーガナイザー、こうした活動を支援している、バイオサイエンスデータベースセンター (NBDC) とライフサイエンス統合データベースセンター (DBCLS)に感謝したい。

science@creativecommons T-shirts now available in the CC store!というニュースのなかで、

Now you can show your love for Creative Commons and science at the same time by buying one of these t-shirts, available for $20 over at the CC store.

を目にしてしまったら、購入しないわけにはいかないだろう。

Science Commonsは、サイエンスにおける情報共有や研究活動のオープン化を進めることを目的とした、クリエイティブ・コモンズの派生プロジェクトだ。

Science@creativecommonsのTシャツは、ウェブコミックXKCDのカートゥーンの使用許諾を得たデザインになっている。このTシャツ3枚にScience Commonsのステッカーが付いてきた。

If you love science as much as we do, then hurry over to the CC Store and get your limited edition shirt today!

もっともこのScience@creativecommonsのTシャツを着ることができるのは当分先のことになりそうだ。Tシャツを着ることができるのは先のことだが、オープンなマインドでサイエンスを楽しむ気持ちはいつも持ち続けたいね。

ドイツはオーガニックなハーブティーの種類が豊富だ。これでシュトーレンがあれば言うことはない。今夜のハーブティーは、ハーブティーをもったかえる君が描かれた„FROSCH IM HALLS‟の„SMOOTHING THROAT‟のハーブティーだ。

NMLのNML特選クリスマス名曲集をかけながら、アドベントカレンダーティーをおいしくいただいた。

かえるくんというと、村上春樹氏の短編集「神の子どもたちはみな踊る」に収められている「かえるくん、東京を救う」の短編を思い出す。もっとも、この短編集のなかでは「蜂蜜パイ」の短編がもっとも気に入っているのだが。この「神の子どもたちはみな踊る」はロバート・ログヴァ監督によって映画化され、今年10月に日本で公開された。神戸への学会出張のパッキングしているときに、ふと「神の子どもたちはみな踊る」を手にとり、スーツケースに入れた。神戸に滞在中、ホテルのベッドで眠りに就く前に丁寧に読み返した。

… かえるくんは口をつぐみ、話し疲れたように軽く目を閉じた。
「それで」と片桐は言った。「あなたと私と二人で地下に潜り、みみずくんと闘って、地震を阻止する」「そのとおりです」…
- 村上春樹「 かえるくん、東京を救う」（「神の子どもたちはみな踊る」より）

神戸では仕事の合間をぬって、神戸ルミナリエをみて、15年前の震災を思った。すべてはつながっているとそう思いながら、美しい電飾と、お父さんに肩車される幼い子どもたちを見つめた。

平川門から皇居東御苑に入り、天神壕をみながら、梅林坂を上ってゆく。梅林坂には梅林のなかの一株の紅冬至の梅が、この厳しい寒さのなか可憐な花を咲かせていた。

万葉集に筑前介佐氏子首が詠んだ梅の花の和歌がある。

万代に年は来経とも梅の花絶ゆることなく咲きわたるべし
-  万葉集 八三〇番 筑前介佐氏子首

梅林坂は文明10年（1478年）に太田道灌が菅原道真を祀り、梅樹数百株を植えたためにこの名があるといわれている。もっとも現在の梅樹は昭和42年（1967年）に植えられたものとのことである。この紅冬至の梅が絶ゆることなく咲くように、万代に人々がこの梅を楽しむことができればいいのだが。

皇居東御苑の魅力は、二の丸庭園や花菖蒲もさることながら、二の丸雑木林だろうと思う。

消えていく武蔵野を救おう、武蔵野の面影をここに残そうとの昭和天皇のご意向が実り、あの雑木林は誕生したのです。…しかし、あまり知られてはいないのですが、この雑木林を作った背景には、もうひとつの大きな理由がありました。…昭和天皇は大正12年の関東大震災をご経験なさっております。…そのときに被災の現場をご覧になって、その悲惨さを身をもって実感されていたのです。「武蔵野の森を残したい」とのお考えになられたのは、実はこの関東大震災のご記憶によるところが大きかった。東京の町から空き地や雑木林が年々失われていく様をお嘆きになり、もし、再び関東大震災のような災害が起こったら、このままでは市民が避難する場所さえなくなってしまうとお考えになられた。ならば、ここに避難場所を確保しよう……それが、二の丸の雑木林をお作りになった昭和天皇のご意向だったのです。避難場所にするためには、ただ広場だけを用意するのではいけない。舗装したり、芝を植えただけの広場だと、夏なんか暑くていられない。だから森を作れ – そこまで考えておられた。しかもその森の中に、一般の市民が歩けるような小道を通せ、舗装はするなという仰せでした。そうすれば、普段は市民の憩いの場となり、非常時には避難できる場所になる。昭和天皇は科学者として厳しい目で自然を観察なさる一方で、こうした非常時のことも常にお考えになり、さらにその上で非常に優しい眼差しを、この皇居の自然に注いでいらっしゃったのです。
- 田中 直（元昭和天皇侍従）平成7年談「皇居の森」

二の丸雑木林の小径を分け入って歩くと、武蔵野の自然のなかに分け入っているようで、東京の真ん中にいることを忘れてしまう。

三の丸尚蔵館の近くに十月桜が2株ほどこちらも可憐な花を咲かせていた。

これから梅林坂の紅冬至や八重寒紅の梅の花が咲きそろってゆくのだろう。また散策するのが楽しみだ。

本郷真砂坂のこじんまりとした焼きたてスコーン専門店である。店名のコナノコ スコーンは粉の子どものようなかわいくて美味しいスコーンをイメージしたとのこと。焼きたての、さまざまな種類のスコーンを、紅茶やコーヒーと共に楽しむことができる。国産小麦、アルミニウムフリーのベーキングパウダーと自家製酵母を使用している。

4種類の異なる生地を使用し、さくふわ、ざくほろ、ざくざくの異なる食感の10数種類以上の焼きたてのスコーンを楽しむことができる。

バニラビーンズとハニーレモンのスコーン、それにカプチーノをいただいたが、バニラビーンズはさくふわの食感で、小麦粉の風味も高く、おいしかった。

白を基調とし、木製のテーブルと椅子の落ち着いた雰囲気のなか、スコーンはもちろん、紅茶やコーヒーを楽しむことができる。テイクアウトもできる。真砂坂ということで、人通りもそれほど多くなく、こじんまりとしているので、静かに読書しながらアフタヌーンティーをしたいときにうってつけの、そんなスコーン専門店である。

コナノコ スコーン 東京都文京区本郷4-15-6 共栄ビル 1F
平日・土曜日 8:00-20:00, 日曜日・祝日 11:00-18:00

参加者はおおよそ1万人ほどであろうか。プログラムは特別講演、シンポジウム、ワークショップ、一般口頭発表、ポスター発表、バイオテクノロジーセミナーなどにより構成されている。シンポジウム、ワークショップは、従来100テーマ程度開催されていたものを70テーマ程度に絞られていた。ポスター発表は5,154件にのぼっていた。

ちなみに、ライフサイエンス QA (β)をもとに集計すると、いわゆる次世代シークエンサー関連の研究発表はワークショップ8件、シンポジウム2件、ポスター96件の計104件で、ポスター発表が5,154件であることを考えると、意外と少なかった。

私は以下のポスター発表を行った:
3P-1308
AlzPathway: アルツハイマー病のリスク遺伝子探索や分子機序の解明のための網羅的パスウエイマップ
飯島里紗, 水野聖士, 荻島創一*, 菊地正隆, 宮下哲典, 桑野良三, 福原武志, 田中博

製薬企業の研究者をはじめとした方々に興味をもっていただくことができ、有意義なディスカッションをすることができた。

今回、初めて大判ポスターを作製した。KeynoteとPosteRazorによりA3に分割印刷して、ポスター会場でつなぎあわせた。

空き時間をみつけて、神戸ルミナリエにでかけた。美しい電飾のもとで、幼い子どもたちがお父さんに肩車されている光景は、この神戸ルミナリエをはじめた神戸の人々の夢だったのではないだろうか。開催経費の資金繰りが悪化しているということで、100円募金をさせていただいた。

共同研究者をはじめとした、さまざまな研究者と交流することができ、非常に有意義な学会であった。それにしても、twitterをはじめとした、インターネット上のソーシャルなメディアにより、”フラット”な研究者のネットワーク形成とそれによる情報交換やコラボレーションが加速しているのを肌で感じた学会だった。